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200px Foldit显示蛋白质折叠过程 |
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開發者 | 华盛顿大学 Departments of Computer Science & Engineering and Biochemistry. |
初始版本 | 2008 |
作業系統 | Windows, Mac OS X, Linux |
文件大小 | 53.03 MB |
語言 | 英语 |
開發狀態 | 活动 |
類型 | 电子游戏 |
許可協議 | 私有软件 |
網站 | http://fold.it/ |
Foldit是一个实验性的蛋白质折叠电子游戏,由华盛顿大学的计算机科学和工程学系和生物化学学系(同一批人中,很多人也參與创建Rosetta@home)聯合共同開發。第一个beta公開測試版在2008年5月釋出。
Foldit提供一系列教程,讓用户試著操縱简单的類蛋白质構造,並定期更新以真實蛋白質結構為基礎的謎題。該程序讓用户在工具辅助解謎,就能够得出實際的蛋白质模型。每當結構被变动,一个"分数"会根据折叠的完善程度给出。Foldit用户可以创立加入小组,分享各自的方案。也有小组高分榜。
生物製造主要蛋白質結構的方式(蛋白質生物合成)在理性上已經為人類所瞭解,此即蛋白質DNA測序的方法。決定蛋白質主要結構轉化為功能性三维結構(蛋白質分子如何「折疊」)是更為困難的;雖然大致的程序已經為人所知,但蛋白質結構預測還是需要大量的運算。
Foldit嘗試利用人腦天生的三維pattern matching能力。目前該程式出的謎題都是基於已被人們清楚瞭解的蛋白質;透過分析人類在解這些謎題時的直覺思考途徑,研究者希望能改進現有蛋白質折疊軟體所用的演算法。
科學家們一直研究愛滋病的其中一項蛋白質 ”Retroviral Protease” 有十五年之久,這種蛋白質酶是愛滋病毒在活體細胞中複製和繁殖自己的重要關鍵,但就在上個禮拜,Retroviral Protease 的結構完全被玩家們破解─而且只花了十天的時間。
該蛋白質酶的結構被解開以後,學者們就可以針對該分子下手,製造出能抑制愛滋病毒生長的新藥物。同時,該篇突破性的研究也已經發表在 Nature旗下的Nature structural & molecular biology雜誌 上。
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